Nommé Doyen de l’École des affaires mondiales et publiques de l’IE entre janvier 2017 et janvier 2020, période pendant laquelle il exerça également ses fonctions en tant que Directeur du Centre pour la gouvernance du changement de l’IE, une institution entièrement consacrée à l’étude des enjeux soulevés par les changements dans la sphère technologique et sociale, il fut également titulaire de la chaire Rafael del Pino sur la transformation mondiale et a dirigé le Programme de leadership mondial de la Fondation Rafael del Pino.
Par ailleurs, entre les années 2015 et 2017, Manuel Muñiz était en charge du Programme sur les relations transatlantiques de l’université de Harvard. Depuis 2017, on le compte parmi les « fellow » et l’un des instigateurs du Projet pour l’Europe et la relation transatlantique du Harvard Belfer Center for Science and International Affairs.
Manuel Muñiz est titulaire d’une maîtrise en Droit de l’université Complutense de Madrid, d’un master en Bourse et marchés financiers de l’Institut des études boursières, d’un master en Administration publique décerné par la Kennedy School of Government et d’un doctorat en Relations internationales de l’université d’Oxford. Il a été en outre David Rockefeller Fellow de la Commission trilatérale et Millennium Fellow de l’Atlantic Council. En 2016, il est nommé par Esglobal comme l’un des 25 intellectuels chargés de redéfinir le courant de pensée latino-américain.