El Ministerio tiene cuatro Secretarías de Estado: de Asuntos Exteriores y para Iberoamérica y el Caribe, para la Unión Europea, de Cooperación Internacional y de la España Global.
Juan González-Barba Pera fue nombrado secretario de Estado para la Unión Europea en el Consejo de Ministros celebrado el 4 de febrero de 2020.
Ángeles Moreno Bau fue nombrada secretaria de Estado de Cooperación Internacional en el Consejo de Ministros celebrado el 4 de febrero de 2020.
Manuel Muñiz Villa fue nombrado secretario de Estado de la España Global en el Consejo de Ministros celebrado el 28 de enero de 2020.