Asimismo, coordina las actuaciones de otras Administraciones públicas en la Unión Europea, e imparte instrucciones al Embajador Representante Permanente de España ante la Unión Europea.
De la SEUE dependen dos direcciones generales y la Abogacía del Estado ante el Tribunal de Justicia de la Unión Europea:
Dirección General de Coordinación de Políticas Comunes y de Asuntos Generales de la Unión Europea
Le corresponde, entre otras funciones, el seguimiento y coordinación de las actuaciones de los Ministerios; la gestión de la solicitud y notificación de ayudas públicas; el asesoramiento general sobre los temas jurídicos de la UE; la preparación del Consejo y del Comité Consultivo del Mercado Interior de la UE; la preparación de las reuniones del Consejo de Asuntos Generales, y el seguimiento y coordinación de las cuestiones institucionales de la Unión Europea y, en particular, de sus reformas.
Su director general es Alejandro Abellán García de Diego. Nacido en Madrid en 1963, ingresó en la Carrera Diplomática en 1991. Ha ocupado puestos en la Embajada de España en El Salvador y en las Representaciones ante el Consejo de Europa y la Unión Europea.
Dirección General de Relaciones Bilaterales con Países de la Unión Europea, Países Candidatos y Países del Espacio Económico Europeo
Es responsable de la propuesta y ejecución de la política exterior de España en su área geográfica correspondiente y el impulso de las relaciones bilaterales con los países que engloba.
Su directora general es María Victoria Morera Villuendas. Nacida en 1956 en Madrid, es diplomática desde 1982. Después de ocupar diferentes destinos en España y en el exterior, fue subsecretaria del Ministerio de Asuntos Exteriores y, posteriormente, embajadora de España en Bélgica y embajadora directora de la Unidad de Emergencia Consular.