Asimismo, coordina las actuaciones de otras Administraciones públicas en la Unión Europea, e imparte instrucciones al Embajador Representante Permanente de España ante la Unión Europea.
De la SEUE dependen dos direcciones generales y la Abogacía del Estado ante el Tribunal de Justicia de la Unión Europea:
Dirección General de Coordinación de Políticas Comunes y de Asuntos Generales de la Unión Europea
Le corresponde, entre otras funciones, el seguimiento y coordinación de las actuaciones de los Ministerios; la gestión de la solicitud y notificación de ayudas públicas; el asesoramiento general sobre los temas jurídicos de la UE; la preparación del Consejo y del Comité Consultivo del Mercado Interior de la UE; la preparación de las reuniones del Consejo de Asuntos Generales, y el seguimiento y coordinación de las cuestiones institucionales de la Unión Europea y, en particular, de sus reformas.
Su director general es José Pascual Marco Martínez. Nacido el 13 de febrero de 1958 en Madrid, es licenciado en Filosofía y en Derecho, e ingresó en 1983 en la Carrera Diplomática. Ha sido embajador de España en la República Democrática del Congo y en la República del Congo. Desde julio de 2015 era director general de Política e Industrias Culturales y del Libro.
Dirección General de Relaciones Bilaterales con Países de la Unión Europea, Países Candidatos y Países del Espacio Económico Europeo
Es responsable de la propuesta y ejecución de la política exterior de España en su área geográfica correspondiente y el impulso de las relaciones bilaterales con los países que engloba.
Su director general es Juan López-Herrera Sánchez. Nacido en 1961 en Sevilla, es licenciado en Derecho e ingresó en 1989 en la Carrera Diplomática. Ha estado destinado en las representaciones diplomáticas españolas en Brasil, Uruguay, Perú, Portugal, Sudáfrica, Bélgica, Cuba y Reino Unido. Ha sido consejero y jefe adjunto en la Jefatura de Protocolo de la Presidencia del Gobierno y subdirector general para Organizaciones Técnicas Internacionales.